变形杆菌食物中毒的病因主要是摄入了被变形杆菌污染的食物，具体如下：

• 变形杆菌的污染：变形杆菌广泛存在于自然界，如土壤、水和动物肠道等。它能在蛋白质丰富的食物中生长繁殖，像肉类、鱼类、蛋类和奶制品等。在食物的加工、储存和烹饪过程中，若受到变形杆菌污染，就可能引发食物中毒。例如，食品加工人员或餐饮从业人员患有肠道疾病或手部感染，加工食品时可能使食品受到污染；食品在加工、运输、贮存过程中，使用不干净的水源、餐具等，也会导致污染；食品原材料如肉类、禽类、海鲜等，在养殖、宰杀、运输过程中受到污染，同样可能带来变形杆菌。
• 食物的不当处理和储存：食物处理和储存方法不正确是导致变形杆菌污染的重要原因。比如，食物没有彻底煮熟，未能杀死可能存在的变形杆菌；生熟食品交叉污染，使熟食品被变形杆菌污染；食物保存温度不当，过高或过低都可能为变形杆菌的生长创造有利条件，尤其是在室温下放置时间过长，会促使细菌大量繁殖并产生毒素。
• 个体的易感性：并非所有人接触被变形杆菌污染的食物都会发病，个体易感性起着重要作用。一些人对变形杆菌毒素更为敏感，或者本身存在消化系统疾病、免疫系统问题，就更容易受到感染。老年人、儿童和孕妇等特殊人群，身体免疫力较弱，也属于易发生食物中毒的群体。