显微型多血管炎可能会有后遗症，这与疾病对身体各系统的损害以及治疗效果等因素有关，以下是一些可能出现的情况：
- 肾脏方面：肾脏是显微型多血管炎最常累及的器官之一。部分患者即使经过治疗，仍可能遗留不同程度的肾功能损害，如持续性的蛋白尿、血尿，严重者可发展为慢性肾功能衰竭，需要长期进行透析治疗或肾移植。
- 肺部方面：肺部受累也较为常见，可表现为咳嗽、咯血、呼吸困难等。病情控制后，部分患者可能会出现肺间质纤维化，导致肺功能下降，出现活动后气短、呼吸困难等症状，影响生活质量。
- 神经系统方面：20%-30% 的患者有神经系统损害的症状，其中约 57% 出现多发性单神经炎或多神经病变，表现为局部周围感觉或运动障碍。即使在病情缓解后，神经损伤可能仍无法完全恢复，遗留肢体麻木、疼痛、感觉异常、肌肉无力或萎缩等后遗症，影响肢体的正常运动和感觉功能。
- 其他方面：还可能累及皮肤、关节、消化道、心血管等多个系统。如皮肤可出现紫癜、溃疡、网状青斑等，愈合后可能会留下瘢痕或色素沉着；关节受累可导致关节疼痛、活动受限，长期可能引起关节畸形；消化道受累可能出现腹痛、腹泻、消化道出血等，影响营养吸收，导致体重下降、贫血等；心血管受累可出现高血压、心肌梗死、心律失常等，增加心血管疾病的风险，影响心脏功能。
