小儿大动脉转位是一种严重的先天性心血管畸形，其病因主要与胎儿发育过程中的异常变化有关。可以总结出以下几点：

1. 基因突变和遗传因素
   基因突变是导致大动脉转位的重要原因之一。这些突变可能影响心脏发育的正常过程，从而导致主动脉和肺动脉位置互换。家族遗传病史也可能增加患病风险。

2. 胚胎发育异常
   在胎儿发育过程中，心血管系统的形成是一个复杂的过程。大动脉转位通常与胚胎期心管扭转异常或动脉圆锥发育分隔异常有关。例如，在胎龄5-6周时，心管扭转的异常可能导致主动脉和肺动脉的错位。

3. 染色体畸变
   染色体异常（如唐氏综合征）也与大动脉转位的发生密切相关。染色体异常可能干扰心血管系统的正常发育，从而导致这种畸形。

4. 母体环境因素
   母体在孕期受到有害物质的刺激（如感染、药物暴露或营养不良）可能影响胎儿的心脏发育，从而导致大动脉转位。

5. 其他先天性心脏病
   大动脉转位常与其他先天性心脏病伴发，如室间隔缺损、房间隔缺损或动脉导管未闭等。这些伴随畸形可能进一步加重病情。

6. 感染性因素
   感染性疾病（如风疹、巨球蛋白血症）在妊娠期间可能通过血液循环影响胎儿心血管系统的发育，从而诱发大动脉转位。

7. 解剖学因素
   大动脉转位的发生与动脉圆锥的发育异常密切相关。正常情况下，动脉圆锥的下部应形成主动脉瓣，而上部应形成肺动脉瓣。但在大动脉转位中，这些结构的位置发生逆转，导致主动脉连接到右心室，而肺动脉连接到左心室。

小儿大动脉转位的病因是多因素的，包括基因突变、胚胎发育异常、染色体畸变、母体环境因素、感染性因素及其他先天性心脏病等。这些因素共同作用，导致主动脉和肺动脉的位置异常互换，从而形成这一严重的先天性心血管畸形。