如果新生儿获得性免疫缺陷综合征不进行治疗，可能会导致以下严重后果：

1. 感染风险增加：患儿的免疫系统无法有效抵抗病原体，容易反复发生各种严重感染。常见的感染包括肺炎、败血症、腹泻、皮肤感染等。这些感染往往难以控制，且可能迅速恶化，危及生命。

2. 生长发育受阻：由于反复感染和营养不良，患儿的生长发育可能会受到严重影响。他们可能会出现体重不增、身高增长缓慢、小头畸形等问题。

3. 器官功能损害：长期的感染和炎症反应可能导致器官功能受损。例如，肺部感染可能引发呼吸衰竭，肝脏和脾脏肿大可能影响其正常功能。

4. 肿瘤易发：免疫系统的缺陷使得患儿更容易患上恶性肿瘤，如卡波西肉瘤、淋巴瘤等。这些肿瘤的发生进一步增加了治疗的难度和复杂性。

5. 神经系统问题：某些类型的免疫缺陷综合征还可能影响神经系统的正常发育，导致智力障碍、癫痫等神经系统问题。

6. 死亡风险提高：未经治疗的新生儿获得性免疫缺陷综合征预后极差，病死率极高。患儿可能在出生后数月内因严重感染或其他并发症而死亡。

新生儿获得性免疫缺陷综合征如果不进行治疗，会对患儿的健康和生命造成严重威胁。一旦确诊，应立即采取积极的治疗措施，以改善患儿的预后和生活质量。家长也应密切关注患儿的病情变化，定期复诊，并遵循医生的建议进行规范治疗。