农村合作医疗住院报销确实存在额度限制，具体分为以下几个方面：

一、年累计报销限额

1. 最高支付限额

   各地政策对年累计报销金额设限，例如：

   • 2025年新型农村合作医疗年累计最高报销额度为 40000元 （部分地区可能更高）；

   • 部分地区年累计报销限额为 15万元 （含重大疾病专项补助）。

2. 封顶线作用

   当年累计报销金额超过封顶线后，超出部分需由个人承担。例如，某地封顶线为40000元，若某参保人年累计医疗费用为50000元，则超出10000元需自费。

二、分段报销比例

不同等级医疗机构实行差异化的报销比例，具体如下：

1. 一级医疗机构（镇卫生院/村卫生室）

   • 起付线以下（如200元）：不报销

   • 起付线以上：按65%比例报销。

2. 二级医疗机构

   • 起付线以下（如500元）：按25%比例报销

   • 起付线以上至10000元：按55%比例报销

   • 超过10000元部分：按50%比例报销。

3. 三级医疗机构

   • 起付线以下（如1000元）：按20%比例报销

   • 起付线以上至10000元：按45%比例报销

   • 超过10000元部分：按40%比例报销。

三、其他注意事项

1. 起付线标准 ：不同级别医疗机构起付线不同，例如一级100元、二级500元、三级1000元。

2. 报销范围 ：仅限医保目录内的药品、检查、手术等有效医药费用，自费项目（如美容手术、高档药品）不在报销范围内。

3. 累计报销次数 ：同一统筹期内多次住院可累计报销，但需符合当地累计报销限额。

四、补充说明

• 大病专项补助 ：部分地区对特定大病（如癌症、尿毒症）提供额外补助，例如门诊统筹补助比例可达70%-80%。

• 地区差异 ：具体报销比例和限额因地区政策不同而有所差异，建议参保人员咨询当地医保部门获取最新信息。

以上信息综合了2025年最新政策及多地通用规则，实际报销以参保地官方文件为准。