肾皮质化脓性感染，如果治疗不及时或不当，确实可能会留下一些后遗症。以下是一些可能的后遗症：

1. 肾功能损害：肾皮质化脓性感染可能导致肾脏组织受损，进而影响肾功能。这种损害可能是永久性的，导致患者长期存在肾功能不全的情况。

2. 肾实质瘢痕形成：感染治愈后，肾皮质可能会形成瘢痕组织，这些瘢痕组织会影响肾脏的正常结构和功能，有时甚至会导致肾脏萎缩。

3. 肾周脓肿：如果感染未能得到及时控制，可能向周围组织扩散，引起肾周脓肿。这是一种严重的并发症，需要进一步的治疗。

4. 慢性疼痛：部分患者在感染治愈后仍可能感到腰部或腹部的慢性疼痛，这可能与肾脏组织的损伤和瘢痕形成有关。

5. 反复发作：如果感染未完全清除或患者免疫力低下，肾皮质化脓性感染有可能反复发作，给患者带来更大的痛苦和不便。

6. 败血症风险：在极少数情况下，如果感染严重且未得到及时治疗，细菌可能进入血液循环，引起败血症等全身性感染疾病。

为了减少后遗症的发生，关键在于早期诊断、及时治疗以及遵循医生的建议进行规范治疗。患者在康复期间也应注意保持良好的生活习惯和饮食习惯，以促进身体的康复。如果出现任何不适症状或疑虑，应及时就医并告知医生相关情况。