入职三个月尚未转正的处理方式需根据具体情况判断，以下是综合法律建议：

一、试用期转正的基本条件

1. 工作表现达标 ：需完成岗位任务，达到考核标准；

2. 通过考核 ：通过试用期考核，证明具备岗位能力；

3. 符合录用条件 ：满足合同约定的学历、技能等要求。

若未满足上述条件，用人单位可依法终止合同；若用人单位未依法处理，可能视为自动转正。

二、用人单位不转正的合法情形

1. 员工不符合录用条件

   用人单位可依据《劳动合同法》第三十九条规定解除劳动合同，并支付工资；

2. 违法延长试用期

   若用人单位超过法定试用期（如3个月未转正但试用期超过1个月）未转正，属于违法行为，劳动者可要求按正式员工待遇支付工资，并主张经济补偿。

三、劳动者的维权途径

1. 沟通协商

   首先与用人单位沟通未转正原因，要求明确转正时间或解决方案；

2. 收集证据

   整理工作成果、考核记录等证据，为后续维权提供支持；

3. 申请劳动仲裁

   若协商无效，可向用人单位所在地劳动争议仲裁委员会提交书面申请，要求继续履行合同或支付赔偿金；

4. 投诉举报

   若存在用人单位无理拒绝聘用或违法延长试用期，可向劳动监察部门投诉。

四、注意事项

• 试用期工资计算 ：用人单位应按实际工作天数结算工资，不得以未转正为由克扣；

• 合同条款审查 ：入职前应仔细阅读合同条款，明确试用期时长及转正条件。

通过以上步骤，劳动者可依法维护自身权益，确保试用期管理符合劳动法律法规。