根据最新政策规定和搜索结果，南京医保卡在南通的使用情况如下：

一、目前政策限制

1. 省内异地就医需备案

   南京医保卡在江苏省内其他城市（包括南通）就医需办理异地就医备案手续，未备案则无法直接刷卡结算。备案可通过“我的南京”第三方平台办理。

2. 跨省异地就医限制

   • 门诊/住院 ：目前仅支持跨省住院费用直接结算，门诊费用需先自费后报销。

   • 零售药店 ：暂不支持直接结算，需回参保地报销。

3. 电子医保卡功能差异

   • 南京电子医保卡 仅限本地使用 ，无法在南通实现门诊、住院刷卡结算。

二、南通医保卡在南京的使用情况

• 直接结算 ：南通医保卡无法在南京直接用于门诊、住院报销，需按上述流程办理异地就医备案。

• 报销流程 ：需在南通完成转诊证明、备案登记等手续，持发票、医疗本、社保卡、户口本等材料回南通社保局报销。

三、建议操作步骤（以南京参保人员为例）

1. 办理异地就医备案

   登录“我的南京”平台，进入“智慧人社-社会保险-异地就医备案”模块，按提示填写并提交材料。

2. 就医时使用

   在南京的医保定点医疗机构就医时，直接刷卡结算门诊/住院费用。

3. 费用报销

   回到南通后，携带相关材料至社保局办理报销手续。

四、注意事项

• 若未办理备案，所有异地医疗费用需自费，可能产生高额费用。

• 部分城市（如上海）支持跨省直接结算，但其他省份暂不支持。

• 建议通过官方渠道办理备案，避免因材料不全影响报销。

如需进一步确认，建议联系南京或南通的医保经办机构，获取最新政策细则。