可以

农村合作医疗可以报销手术费。

新农合报销分类主要分为门诊报销、住院报销、大病报销这三类。门诊报销中明确规定了村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元，中药发票附上处方每贴限额1元。住院报销中规定了新脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等辅助检查项目限额报销200元。手术费起付线1000元内按照国家标准报销，超过1000元按照1000元报销。60岁以上老年人住院治疗费及护理费每天可报销10元，限额200元。各级医院报销比例为：镇卫生院报销60%，二级医院报销40%，三级医院报销30%。大病报销中规定了镇风险基金补偿：凡参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿年限额1.1万元。