根据最新政策，南通到南京异地就医备案可通过以下方式办理，具体流程如下：

一、线上备案方式

1. 国家医保服务平台APP或微信小程序

   • 下载“国家异地就医备案”小程序或登录“国家医保服务平台”APP，选择“跨省异地就医备案”；

   • 填写就医城市、就医原因，并上传身份证、社保卡照片等材料；

   • 完成人脸识别和电子签名后即可生效。

2. 南京市医保相关平台

   • 关注“南京医保”微信公众号或登录“我的南京”APP，进入“异地就医备案”模块；

   • 选择“长期异地备案/临时外出备案/承诺备案”，上传材料并确认；

   • 建议选择“承诺备案”模式（无需上传材料）。

二、线下备案方式

1. 南通市医保窗口

   • 携带身份证、异地就医申请表（可通过南通医保APP下载）等材料，前往南通市医保经办机构窗口办理；

   • 部分机构支持电话或邮寄材料。

2. 南京市医保窗口

   • 携带身份证、异地就医转院申请表（二级及以上医院开具）等材料，到南京市医保经办机构窗口办理。

三、注意事项

• 备案时效 ：线上备案通常为长期有效，跨省备案需每年更新；

• 特殊人群 ：大学生可通过“我的南京”APP为单位职工批量备案；

• 费用报销 ：异地就医直接结算需符合参保地政策，门诊费用一般按比例报销。

建议优先使用国家医保服务平台APP办理跨省备案，若在南通本地长期居住，可关注南通医保APP的“长居异地备案”功能。办理前建议通过医保局官网或APP确认最新流程及材料要求。