诺卡菌病的表现因感染部位不同而有所差异，具体如下：
- 皮肤感染
- 皮损表现：多有皮肤外伤史，特别是与泥土接触史。开始为暗红色丘疹、结节、脓疱，逐渐融合形成斑块或多发性脓肿，与皮肤粘连，破溃后形成瘘管，流出血性脓性分泌物。皮损长期存在会有瘢痕形成，结节反复出现、溃破，终年不愈，可形成大块硬块，表面高低不平。
- 感染特点：若无继发细菌感染，局部自觉症状轻微。一般健康人可自愈，少数原发皮肤感染会进一步发展至皮下组织，累及皮下组织、筋膜和骨骼，多见于手、足部，表现为无显著自觉症状的慢性局限性皮肤肿胀，有窦道形成，窦道脓液中常见白色或黄色的颗粒，可形成组织破坏、畸形，少数可经血行扩散引起内脏感染。
- 肺部感染：是最常见的类型。起病可急可缓，表现为咳嗽，开始为干咳，无痰，继而产生黏脓性痰，也可在痰中带血，若有空洞形成，可有大量咯血。常伴有发热、寒战、胸痛、乏力、食欲缺乏和体重减轻，可有胸腔积液。胸部 X 线表现多种多样，如肺段或肺叶浸润性病变、厚壁空洞、坏死性肺炎、大叶性肺炎、单发或多发性肺脓肿、孤立性或多发性结节、胸腔积液、支气管胸膜瘘等，亦可表现为肺内粟粒性阴影，但较为少见。
- 脑部感染：多由肺部病灶播散而来，典型表现为脑脓肿形成。临床表现缺乏特异性，多表现为发热、头痛、抽搐、麻木、颈项强直、神志模糊等，还可出现头晕、恶心、呕吐、偏瘫、视力障碍、视盘水肿、瘀血、外周血白细胞计数增高等症状。免疫功能正常的患者临床上可多年无异常表现。
- 播散性感染：除脑之外，还可播散至肾、胸膜和胸壁、肝、淋巴结、眼等，又以肾、胸膜和胸壁多见，其他还可累及心包、心肌、胃肠道、脾、胰腺、甲状腺、垂体、膀胱等。可引起多系统受累症状，如肝脾肿大、关节疼痛等。
眼部诺卡菌病可导致脉络膜炎、角膜炎、视网膜脓肿以及视网膜脱落等疾病，严重时可致失明，临床表现为视力下降、畏光、疼痛、眼睑痉挛及肿胀等。
