多系统萎缩的早期症状复杂多样，主要包括以下几个方面：
- 自主神经功能障碍
- 泌尿生殖系统：尿频、尿急、夜尿增多是常见表现，严重时会出现尿失禁，部分患者还存在膀胱排空障碍。男性常早期出现勃起功能障碍，女性则可能有外生殖器敏感度降低的情况。
- 心血管系统：体位性低血压较为突出，患者从坐位或卧位站起时，会突然头晕、眼前发黑，甚至晕厥，还可能伴有餐后低血压，部分患者会有以颈肩为中心的疼痛，即 “衣架样疼痛”。
- 皮肤汗腺：自主神经损伤会导致排汗异常，部分患者皮肤干燥脱屑，尤其是手脚部位；而有些患者在进食时面部会异常多汗，还可能伴有体温调节障碍，如怕冷或怕热。
- 运动障碍
- 帕金森样症状：约 60% 的患者早期会出现类似帕金森病的运动障碍，有动作迟缓、肢体僵硬、步态不稳等表现，比如走路时手臂摆动减少、转身困难、写字越来越小。但与帕金森病不同的是，多系统萎缩患者对左旋多巴类药物反应较差，病情进展更快。
- 小脑性共济失调：表现为进行性步态和肢体共济失调，以下肢症状更为突出，患者走路不稳、易跌倒，有明显的构音障碍和眼球震颤，检查可发现下肢受累较重的小脑病损体征。
- 睡眠障碍：部分患者会出现快速眼动睡眠期行为障碍，睡觉时会大喊大叫、拳打脚踢，甚至可能伤及自己或伴侣。更危险的是，夜间可能突发呼吸暂停或喘鸣声，这是由于控制呼吸的神经功能受损。
