根据搜索结果，2025年西藏拉萨市在头疼治疗方面具有较高医疗水平的医院主要包括以下机构：

一、综合实力较强的三级甲等医院

1. 西藏自治区人民医院

   • 地址：林廓北路18号

   • 特色：三级甲等综合医院，集医疗、科研、教学、保健于一体，拥有34个科室和96位医生，擅长脑部疾病及复杂病症的诊疗。

2. 西藏军区总医院（林廓北路18号）

   • 特色：三级甲等综合医院，神经外科和疼痛科在枕大神经痛等头痛相关疾病治疗中具有优势，拥有3个科室和3位医生。

二、其他相关医院推荐

• 西藏自治区皮肤病防治所（金珠中路67号） ：一级甲等专科医院，擅长皮肤相关疾病诊疗，可能对神经性头痛的辅助治疗有专业建议。

• 墨竹工卡县人民医院 ：二级甲等综合医院，位于城关区，提供基础医疗服务。

三、选择建议

• 神经类头痛 ：优先考虑西藏自治区人民医院或西藏军区总医院，神经外科和疼痛科专家资源更丰富。

• 皮肤相关头痛 ：建议前往西藏自治区皮肤病防治所。

• 其他类型头痛 ：可结合具体症状选择综合医院神经内科或疼痛科就诊。

四、挂号提示

• 以上医院可通过拉萨市人民医院官网或官方APP预约挂号。

• 部分医院（如西藏军区总医院）需提前电话预约。

如需进一步了解具体科室医生排班或诊疗流程，可访问医院官网或拨打09991118（拉萨市医疗急救热线）咨询。