重庆农村合作医疗报销比例根据就诊类型和医疗机构等级有所不同，具体如下：

一、门诊报销比例

1. 普通门诊

   • 村卫生室/村中心卫生室：60%

   • 乡镇卫生院：40%

   • 县级医院：30%

2. 特殊门诊

   • 重大疾病门诊：按住院政策报销（具体比例未明确，需结合住院政策）

   • 慢性病门诊：60%-80%（年报销限额1000元/人）

二、住院报销比例

1. 乡镇卫生院 ：60%

2. 二级医院 ：40%

3. 三级医院 ：30%

三、其他注意事项

1. 起付线标准

   • 乡镇卫生院：30元/次

   • 县级医院：200元/次

   • 市级医院：500元/次

   • 省级医院：700元/次

2. 年累计报销限额

   • 一档：8万元

   • 二档：12万元

3. 大病补偿

   • 超过5000元部分分段补偿：5001-10000元65%，10001-18000元70%

4. 新农合与城乡居民医保差异

   • 新农合门诊无起付线，年累计限额25元/人

   • 城乡居民医保门诊年报销限额300元（一档）或500元（二档）

四、异地报销比例

• 本地医疗机构 ：与本地报销比例一致

• 异地定点医院 ：起付线1000元，报销比例45%

以上信息综合了2020-2025年重庆农村合作医疗政策，具体执行以当年官方文件为准。