食品经营许可证通常在经营场所所在地的市场监督管理部门办理，以下是一些常见的办理地点：

• 政务服务中心：许多地方的市场监督管理部门会在当地政务服务中心设置窗口，统一受理食品经营许可证的申请。如北京市昌平区政务服务中心，地址是北京市昌平区龙水路 22 号院 4 号楼三层综合窗口，服务时间是工作日上午 08:30-11:30，下午 13:30-17:00，还提供延时服务和周六服务（法定节假日除外，延时服务需预约）。三明市三元区江滨北路 11 号（碧湖）政务服务中心一楼 128、129、130、131、132 窗口，也可办理食品经营许可证。
• 市场监督管理局分局或其委托的市场监管所：比如天津市食品经营许可由经营场所所在地的区市场监管局或其委托的市场监管所办理，具体办理地址及咨询电话可详见天津网上办事大厅。惠州市大亚湾经济技术开发区实行个体工商户营业执照和食品经营许可证就近办理，澳头、西区街道群众可自主选择到所属街道的市场监管所或区政务服务中心办理；霞涌街道群众在所属街道的市场监管所办理。
• 特定的登记注册分中心：以北京市昌平区为例，除了政务服务中心，昌平区市场监督管理局 “回 +” 双创社区登记注册分中心也可办理，地址是北京市昌平区回龙观镇回龙观东大街腾讯众创空间一层 A109 厅内综合窗口，工作时间是工作日上午 8:30-12:00，下午 13:00-17:00。

部分地区还提供线上办理渠道，申请人可登录当地市场监督管理部门的官方网站或指定的政务服务平台进行申请，如北京市可登录网上政务服平台线上申请。陕西省西咸新区的申请人可在陕西省食品安全监管综合业务网上申报系统申请。