根据搜索材料，以下是一些在重庆治疗皮肤水疱的推荐医院：

1. 1.陆军军医大学第一附属医院（三甲综合公立医院）地址：重庆市沙坪坝区高滩岩正街30号电话：023-65318301特色：该医院皮肤科创建于1954年，积累了丰富的临床诊疗经验，尤其在皮肤肿瘤、脱发、痤疮、色素斑、湿疹、荨麻疹、性病、尖锐湿疣、梅毒、疱疹等方面有较高的造诣。
2. 2.重庆医科大学附属第一医院（三甲综合公立医院）地址：重庆市渝中区袁家岗友谊路1号电话：023-68811360特色：该医院皮肤性病科在激光医学、红斑狼疮等自身免疫性疾病、大疱性疾病、银屑病、性传播疾病、变态反应性皮肤病等方面有较高的造诣。
3. 3.陆军军医大学新桥医院（三甲综合公立医院）地址：重庆市沙坪坝区新桥正街83号电话：023-68755114特色：该医院皮肤科及风湿免疫科在痤疮、银屑病、白癜风、瘢痕疙瘩、过敏性皮肤病、皮肤病理诊断、结缔组织疾病、风湿病、性传播疾病和疑难皮肤病的诊断与治疗方面有丰富的经验。
4. 4.重庆大坪医院（三甲综合公立医院）地址：重庆市渝中区大坪长江支路10号电话：023-68757113特色：该医院皮肤性病科在皮肤溃疡、痤疮、红斑狼疮、大疱性皮肤病、毛发疾病、太田痣、黄褐斑、白癜风、银屑病、血管瘤、皮肤外科性疾病、性病、真菌性皮肤病及皮肤病理诊断等方面有显著优势。
5. 5.重庆市人民医院（三甲综合公立医院）地址：重庆市两江新区渝北区星光大道118号电话：023-63390111特色：该医院皮肤科在常见皮肤病及疑难皮肤病、皮肤美容科、皮肤外科、皮肤性传播疾病等方面有丰富的诊疗经验
6. 6.重庆市中医院（三甲综合公立医院）地址：重庆市道门口40号电话：023-63846333特色：该医院皮肤科在中西医结合治疗皮肤病方面有丰富的经验，特别是在顽固性复发性皮肤疾病、皮肤疾病的外科手术治疗、皮肤激光美容治疗方面有显著优势。
7. 7.重庆朝天门医院（民营皮肤病专科医院）地址：重庆市渝中区新华路142号（长江索道斜对面）电话：185-8105-9277特色：该医院专业诊疗腋臭、过敏、湿疹、牛皮癣、白癜风、鱼鳞病、荨麻疹、青春痘、皮炎等皮肤病

这些医院在皮肤科领域都有较高的声誉和丰富的诊疗经验，您可以根据自己的具体需求选择合适的医院进行就诊。建议在就诊前通过医院官网或电话进行预约，以便更好地安排就诊时间。