农村合作医疗在异地就医的报销比例因地区和具体政策而异，但一般来说，异地就医的报销比例会低于本地就医。以下是一些常见的情况和报销比例：

1. 门诊报销

• 村卫生室及村中心卫生室：报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元
• 镇卫生院：报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元
• 二级医院：报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元
• 三级医院：报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元

2. 住院报销

• 乡镇卫生院：报销60%。
• 二级医院：报销40%。
• 三级医院：报销30%。

3. 异地报销比例

• 乡镇卫生院：起付线为100元，报销比例为90%
• 县级定点医院：起付线为200元，报销比例为82%
• 市级定点医院：起付线为500元，报销比例为65%
• 省级定点医院：起付线为700元，报销比例为55%
• 省外非定点医院：起付线为1000元，报销比例为45%

4. 报销流程

1. 1.备案：在异地就医前，参保人员需要提前联系参保地的医保经办机构进行异地就医的登记报备
2. 2.就医：在异地就医时，参保人员需要自行垫付医疗费用
3. 3.报销：就医后，参保人员需要携带相关单据和材料回到参保地办理报销手续

5. 报销材料

• 门诊报销：门诊发票、合作医疗证历本（或病历）。
• 住院报销：住院发票、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结、其它有关证明。
• 门诊特殊病报销：门诊发票、特殊病种合作医疗证历本。
• 办理特殊病种：特殊病种门诊治疗建议书、合作医疗证历本、病历、有关化验报告单、照片二张。

6. 注意事项

• 提前报备：异地就医报销最重要的便是提前报备，参保人员一定要尽早报备，以避免出现无法报销的情况
• 报销范围：报销范围包括药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合医保目录范围内的费用。

农村合作医疗在异地就医的报销比例和流程因地区和具体情况而异，建议参保人员在异地就医前详细了解当地的政策和规定，并提前做好报备和准备工作。