碱基序列改变不一定是基因突变，需根据具体发生位置和影响范围判断：

一、基因突变成立的两种情况

1. ‌必须发生在基因区‌
   基因是具有遗传效应的DNA片段，只有发生在基因编码区或调控区的碱基改变才会引起基因结构变化。若改变发生在基因间的非功能区域（如重复序列或间隔区），则不属于基因突变‌。

2. ‌需引起基因结构的实质性变化‌
   包括碱基对的替换、增添或缺失，且这些变化需导致基因的碱基序列发生改变。例如，替换若发生在不改变氨基酸密码子的位点（如同义突变），则可能不产生表型影响，但仍属于基因突变的范畴‌。

二、非基因突变的情况

• ‌非基因区域的碱基改变‌
  如卫星DNA、内含子非剪接位点等区域的变化，由于未涉及遗传信息的表达，不属于基因突变‌。
• ‌RNA病毒的碱基变化‌
  对于RNA病毒，其遗传物质为RNA，RNA碱基序列的改变广义上可称为基因突变，但严格来说属于遗传变异而非DNA层面的基因突变‌。

三、基因突变的核心判定标准

基因突变的本质是‌基因内部碱基序列的改变导致遗传信息变化‌，需同时满足以下条件：
① 发生在基因功能区域；
② 引起碱基组成或排列顺序的不可逆改变；
③ 可能通过复制传递给子代‌。

‌总结‌：碱基序列改变是否属于基因突变，取决于其是否发生在基因功能区域并引起遗传信息改变。非基因区的序列变化或未影响遗传功能的改变均不构成基因突变‌。