根据苏州医保政策，学生医保1000元用完后的处理方式如下：

一、门诊医疗费用处理规则

1. 起付标准与报销比例

   学生医保门诊起付标准为500元，年度累计1000元后开始享受医保报销。超过1000元的部分按医院等级比例报销：

   • 三级医疗机构：25%

   • 社区卫生服务医疗机构：14%

   • 其他等级医疗机构：按具体比例（如8%等）。

2. 个人自负额度

   • 普通门诊 ：不同年龄群体有不同自负额度（如45岁以下900元、45-60岁600元、退休300元）。

   • 住院医疗 ：首次500元、第二次250元、第三次及以上100元。

3. 累计超过限额后的费用

   若个人自负累计超过规定额度（如在职职工4000元、退休4800元），超过部分按比例由医保支付。

二、具体操作建议

1. 门诊费用报销流程

   • 出院时主动出示医保卡刷卡结算，系统自动按比例扣除医保报销金额，剩余自付部分由个人承担。

2. 医保卡余额用完后的就医

   • 个人账户余额用完仅指该年度个人自负额度用完，门诊仍可享受医保报销，但需自付超过自负额度后的费用。

3. 注意事项

   • 医保年度从1月1日开始，次年1月1日结束，需按时续费。

   • 特殊病种（如尿毒症、恶性肿瘤等）有单独的报销比例和起付线。

三、补充说明

• 学生医保缴费标准 ：2025年学生儿童每人每年360元，大学生每人每年250元。

• 门诊特定项目 ：如恶性肿瘤放化疗等重大疾病，门诊费用可按90%比例报销。

若遇到医疗费用超出医保支付限额的情况，建议及时咨询社区社保部门或医院医保办，了解补充保障渠道（如大病保险、商业补充医疗保险等）。