诊所自行配药的合法性需结合具体情况判断，主要依据如下：

一、基本合法性判断

1. ‌无许可证禁止生产‌
   未取得《医疗机构制剂许可证》或药品生产/经营资质的情况下，诊所自行加工、配制药品属于违法行为，可能面临行政处罚甚至刑事责任‌。

2. ‌仅限内部使用‌
   若诊所根据临床需要配制市场上无供应的药品，且仅限本机构内部使用（非销售），则可能合法。但需满足以下条件：

   • 药品配制符合国家药品标准；
   • 配制记录完整可追溯；
   • 仅限于本单位使用，不得对外流通‌。

二、特殊情形下的例外

1. ‌村医疗机构的允许范围‌
   村医疗机构的中医师或具备资质的乡村医生，可自种、自采地产中药材并用于执业活动，但不得加工成制剂销售‌。

2. ‌急救等特殊场景‌
   紧急情况下，经患者/家属同意且符合医疗伦理要求，临时配制必要药品可能被允许，但需严格遵循程序‌。

三、违法后果

1. ‌行政处罚‌
   包括没收药品及违法所得、罚款（货值金额10-30倍）、吊销许可证等‌。

2. ‌刑事责任‌
   若自配药被认定为假药/劣药，可能构成生产销售假药罪或非法经营罪，最高可判无期徒刑或死刑‌。

总结

诊所自行配药原则上需取得许可且限于内部使用，擅自生产销售必然违法。特殊情形需严格遵循法律和医疗规范‌。