在2025年，如果您在山东烟台寻找治疗夜间咳嗽的医院，可以考虑以下几家在当地口碑较好、呼吸内科专业较强的医疗机构：

1. 烟台毓璜顶医院：作为烟台市最大的综合性医疗保健中心和三级甲等综合医院，烟台毓璜顶医院拥有丰富的资源和技术力量。这里有多位专家专注于慢性咳嗽、支气管哮喘等疾病的诊治，例如刘建秋医生擅长儿科呼吸系统疾病及急救方面的问题。

2. 烟台山医院：这所医院同样是一家历史悠久且享有盛誉的三级甲等医院，其呼吸内科有几位主任医师如戴红医生，专门处理各种呼吸系统常见病及多发病，尤其是支气管哮喘、慢性咳嗽、支气管炎等领域。

3. 滨州医学院烟台附属医院：该医院是山东省政府批准新建的大型三级甲等综合医院，对于肺部感染、间质性肺病以及慢性气道疾病等方面有着深入的研究和临床经验，像刘书盈医生就在此领域有所专长。

4. 烟台市莱阳中心医院：位于莱阳市的这家三甲医院也提供专业的呼吸内科服务，吴爱芳医生对哮喘、慢阻肺、急慢性咳嗽等多种病症有着丰富的诊疗经验。

5. 龙口市人民医院：虽然级别为三级乙等，但其呼吸内科同样配备了能够有效治疗慢性咳嗽及相关疾病的医疗团队，包括杨丹医生在内的多位专家能够应对复杂的呼吸道问题。

6. 蓬莱市人民医院：另一家三级乙等医院，它不仅在成人呼吸科方面表现出色，在儿童顿咳（即百日咳）等儿科呼吸系统疾病的治疗上也有很好的评价。

7. 烟台业达医院：尽管信息中没有特别提及夜间咳嗽的具体情况，但作为一家三级综合医院，它也能提供相应的医疗服务和支持。

当选择合适的医院时，建议您根据自己的具体情况来决定。比如，如果您的夜间咳嗽可能与过敏有关，那么寻找那些擅长过敏性咳嗽治疗的医生会更为合适；如果是由于其他原因导致的咳嗽，则应优先考虑那些在相应领域内有更多经验和更好评价的医生所在的医院。

考虑到现代医学的发展趋势，很多医院都提供了线上咨询服务，这意味着即使在非工作时间或者不便亲自前往医院的情况下，也可以通过互联网平台获得初步诊断或建议。因此，在做出最终决定之前，不妨先利用这些在线资源获取更多信息，并根据实际情况预约挂号进行面对面的诊疗。

请注意，以上提供的信息基于最新的可用数据，但具体出诊安排可能会有所变动，请务必提前联系相关医院确认最新的医生排班表和服务详情。