根据搜索结果，2025年福建三明市在治疗消化不良方面可选择的医院主要包括以下几家，供参考：

一、综合实力较强的医院

1. 三明市第一医院

   • 科室设置 ：消化内科为三甲综合医院科室，拥有92个科室、637位医生，设有消化病实验室、胃肠动力检查室等先进设备。

   • 诊疗能力 ：擅长胃肠相关性疾病、肝病、胰腺炎等复杂疾病的诊疗，综合评分87，是当地重点专科。

   • 地址 ：梅列区列东街东新一路29号。

2. 三明市第二医院（永安总医院）

   • 科室规模 ：普通内科设有20位可挂号医生，消化内科床位40张，配备有胃肠动力检查室等设施。

   • 专家团队 ：包括正主任医师、副主任医师等，其中在读硕士1人。

   • 节假日安排 ：2025年春节从1月28日（除夕）至2月4日放假，实行节假日门诊（周一至周六）。

二、专科医院及特色科室

1. 三明市中西医结合医院（蛋白丧失胃肠综合征专科）

   • 科室定位 ：三明市消化系病研究所挂靠单位，专注于蛋白丧失胃肠综合征等难治性疾病的诊疗。

   • 医生资源 ：可咨询医生1位，综合评分60。

   • 地址 ：三元区复康路26号沙洲新村13幢。

三、其他建议

• 预约挂号 ：两院区均实行全预约制，可通过医院公众号或第三方平台提前30分钟预约。

• 就诊建议 ：消化不良患者建议优先选择三甲综合医院消化内科，若需专科治疗可咨询蛋白丧失胃肠综合征专科。

以上信息综合了医院规模、诊疗能力及最新科室设置，供患者参考选择。