合作医疗（原新农合）与职工医保的报销比例存在显著差异，具体区别如下：
一、报销比例对比
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职工医保
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门诊报销 ：50%-60%（一级医院），40%-50%（二级医院），30%-40%（三级医院）
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住院报销 ：85%-90%（一级医院），70%-85%（二级医院），60%-70%（三级医院）
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特殊病种 ：部分重大疾病（如肿瘤放化疗）可报销90%
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合作医疗（新农合）
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门诊报销 ：60%（村中心/镇卫生院），40%（二级医院），20%（三级医院）
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住院报销 ：60%（乡镇医院），40%（二级医院），30%（三级医院）
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异地报销 ：比例更低，可能降至30%-40%
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二、保障范围差异
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职工医保 覆盖范围更广，包括门诊、急诊、住院、药店购药、重大疾病治疗（如肿瘤、肾透析）等；
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合作医疗 主要覆盖住院费用，门诊和部分门诊药品费用需自费。
三、缴费标准与待遇延续性
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职工医保 由企业和个人共同缴费，退休后待遇不变；
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合作医疗 过去由个人缴费，2016年已与城镇居民医保合并为城乡居民医保，缴费标准较低。
四、总结建议
职工医保在报销比例和保障范围上均优于合作医疗，尤其适合职工群体。若选择职工医保，建议优先选择三级医院就医以获得更高比例报销；若经济条件有限，可结合城乡居民医保（起付线更低）或补充商业保险。具体报销比例需以当地政策为准。
