职工医保门槛费的扣除方式通常与职工医保费用的缴纳方式紧密相关。以下是几种常见的职工医保门槛费（更准确地说是职工医保费用）扣除方式：

1. 单位代扣代缴：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》第六十条，用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴。这意味着，对于大多数在职职工来说，医保费用（包括门槛费部分）是由单位在职工工资中直接扣除并代为缴纳的。
   • 职工医保的扣费时间通常与单位的发薪日相关，一般在发薪日之后的某个时间点进行扣费，但具体时间可能因地区和单位而异。

2. 个人缴费由银行代扣：

   • 对于无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，他们可以选择到当地社保局办理银行代扣业务来缴纳医保费用。
   • 在这种情况下，医保的扣费时间取决于个人与银行签订的代扣协议中约定的时间。通常，这类人员需要每个月往指定的银行卡中存入足够的金额，以便银行在约定的时间进行扣费。

3. 通过医保卡或社保卡关联账户扣费：

   • 在一些地区，如果职工医保个人账户余额足够，且当地政策允许，职工个人账户中的资金可以用于代缴居民医保费等其他相关费用。
   • 这种情况下，相关部门会从其个人账户中直接扣除相应的费用，操作通常是由社保经办机构或银行根据职工的申请和授权进行的。

职工医保门槛费（或医保费用）的扣除方式主要取决于职工的就业状态、缴纳方式以及当地的具体政策。对于在职职工，通常是由单位代扣代缴；对于灵活就业人员，则可能需要通过银行代扣等方式自行缴纳。同时，一些地区还允许使用医保个人账户余额来缴纳相关费用。