农二师医院有不同的院区,不同院区等级不同,具体如下:
- 新疆生产建设兵团第二师库尔勒医院:是三级甲等医院。该医院始建于 1974 年,是巴州、农二师集医疗、教学、科研、预防保健、急救、康复于一体的国家三级医院、爱婴医院、巴州及农二师医疗保险定点医院,新型农村合作医疗定点医院及医疗商业保险定点医院。
- 新疆生产建设兵团第二师焉耆医院:是二级甲等医院。其前身为中国人民解放军第一野战军二军步兵第六师医院,1953 年部队整编集体转业后更名为农二师医院,1985 年更名为农二师焉耆医院,1994 年被评为地州级二级甲等综合医院、爱婴医院。
农二师下属的团场医院还有一级医院,如新疆生产建设兵团第二师二十四团医院、第二师三十七团医院、第二师三十五团场医院等分别是一级医院。