农村合作医疗确实设有门槛费，这一费用在官方术语中被称为“起付线”或“统筹基金起付标准”，它是指参保人员在定点医疗机构实际发生的医疗费用达到一定金额后，才能开始享受医保报销的最低标准。换句话说，只有当患者的住院费用超过了这个起付线，超过部分才可能按照规定比例由医保基金进行报销。
根据不同的地区和医院级别，起付线的标准有所不同。例如，在某些地方，社区卫生服务中心、一级、二级、三级医院的起付线分别为100元、200元、300元、400元。而在其他地区，如扬州市，一级定点医疗机构的住院补偿起付线为300元；二级定点医疗机构的住院补偿起付线为600元；三级定点医疗机构的住院补偿起付线则为800元。还有部分地区对乡级卫生院设定的起付线一般为100—200元，县级医疗机构为300—500元，市级医疗机构为800—1500元，省级医疗机构甚至高达2000元以上。
值得注意的是，对于一些特殊情况下的患者，比如从二、三级医院转诊至基层医疗机构接受慢性病或康复治疗的病人，可能会免收起付线。这样的政策设计旨在鼓励合理就医行为，减少不必要的大医院就诊压力，并促进基层医疗服务能力的发展。
关于门槛费是否合理的讨论也一直存在。一方面，设置起付线有助于防止小病大治，避免医疗资源浪费；另一方面，如果起付线设定过高，则可能导致农民因经济原因而放弃必要的医疗服务，从而影响健康状况。因此，如何科学合理地设定起付线，使之既能有效引导患者合理就医，又能切实减轻患者的经济负担，是一个需要持续关注和优化的问题。
农村合作医疗保险制度中的门槛费是保障体系的重要组成部分，其具体数额会因地区差异及医院等级的不同而有所变化。了解本地的具体政策对于确保个人权益至关重要。同时，随着国家政策的不断调整和完善，门槛费的相关规定也可能随之更新。如果您需要获取最新的信息，建议直接咨询当地的社会保险机构或者查阅最新的官方公告以获得准确的数据。
