网上申请灵活就业社保的缴费方式如下：
- 通过电子税务局APP缴费 ：
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打开电子税务局APP，进入首页，点击【点击进入社保费】。
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选择【灵活正缴当月以后】，进入灵活就业人员正常缴费（当年当月及以后）。
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选择办理对象为本人或他人，输入姓名、身份证件类型、身份证号，点击【下一步】。
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进入缴费信息提交页面后，选择待缴费数据，提交后选择支付方式，确认缴费。
- 通过微信缴费 ：
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进入微信端后，依次点击【我】-【服务】-【城市服务】。
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搜索“社保缴纳”或“灵活就业医疗保险”、“灵活就业养老保险”，输入姓名及身份证号等信息，点击【下一步】。
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确认应缴费金额无误后，点击【去支付】，跳转至支付界面完成缴费。
- 通过支付宝缴费 ：
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登录支付宝，进入首页，点击【市民中心】-【社保】。
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点击【社保缴费一件事】-【社保缴费】，选择【灵活就业医疗保险】或【灵活就业养老保险】。
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输入姓名及身份证号等信息，点击【下一步】，确认应缴费金额无误后，点击【去支付】，跳转至支付界面完成缴费。
- 通过当地社保局网站或手机APP缴费 ：
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登录当地社保局的网站或手机APP，选择“社保缴纳”或“社保查询”等选项。
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在搜索框中输入关键词，查找灵活就业人员缴纳社保的入口。
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进入缴纳页面，根据提示完成身份认证、缴纳费用等操作，确认缴纳信息无误后，点击“提交”按钮即可完成缴费。
建议选择一种便捷的方式进行缴费，如电子税务局APP或微信，以便足不出户就能完成社保缴费。
