厦门医保转入深圳后看不到余额，可能的原因有以下几种：

1. 系统更新或故障 ：医保系统定期进行更新，可能导致账户信息未及时同步。系统故障也可能导致查询功能无法正常使用。

2. 医保政策调整 ：医保政策可能会发生调整或变更，包括报销比例、报销范围等，这可能会影响个人医保账户的余额情况。

3. 个人信息错误或不完整 ：个人医保账户信息录入错误或不完整，如姓名、身份证号码等，可能导致查询不到余额。

4. 数据同步延迟 ：医保转移过程中存在一些手续或政策上的问题，可能导致数据同步延迟，从而使得余额未能及时显示。

5. 医保卡内余额确实为零 ：由于当前的医疗保险体系尚未实现全国统一联网，医保无法直接异地转移，导致在不同城市就医时面临限制。只有那些由用人单位为员工缴纳的医保，其医保卡内才会存有余额，用于医疗费用。

建议

1. 耐心等待 ：如果余额显示为零，建议耐心等待几天，看系统是否会自动同步数据。

2. 联系转入地医保机构 ：如果等待几天后仍然看不到余额，可以联系转入地医保机构查询具体原因。

3. 检查个人信息 ：仔细检查个人医保账户信息是否录入正确，确保没有错误或遗漏。

4. 了解最新医保政策 ：了解最新的医保政策，确认是否有政策调整影响余额显示。

通过以上步骤，可以逐步排查并解决厦门医保转入深圳后看不到余额的问题。