重庆农村合作医疗分为一档和二档，它们之间存在以下主要区别：
- 缴费标准 ：
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一档：320元/人·年。
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二档：695元/人·年。
- 报销比例 ：
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门诊报销 ：
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一档：一级医疗机构60%，二级医疗机构40%，三级医疗机构不报销。
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二档：每年有1000元门诊费用，需绑定社康医院，门诊大型设备检查和治疗单次最高不超过120元。
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住院报销 ：
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一档：在三级医疗机构报销比例50%，在二级医疗机构报销比例70%，在一级医疗机构报销比例80%。
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二档：在三级医疗机构报销比例55%，在二级医疗机构报销比例75%，在一级医疗机构报销比例85%。
- 报销限额 ：
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一档：年报销限额300元。
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二档：年报销限额12万元。
- 就医原则 ：
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一档：参保人可以在市内任一定点医疗机构就医。
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二档：门诊在绑定社康中心就医，住院在市内任一定点医疗机构就医。
- 其他 ：
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一档：连续参保满一年，在同一个医保年度内自付的门诊基本医疗费用和地补医疗费用超过在岗职工平均工资5%的，超过部分由统筹基金按规定支付70%。
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二档：没有具体时间要求。
建议
根据以上信息，如果家庭经济条件允许，建议选择二档缴费，因为二档的报销比例更高，尤其是在住院报销方面。此外，二档的门诊报销限额也更高，且没有具体的时间要求，更加灵活。
