微小核糖核酸病毒性角膜炎的治疗需要专业的医疗团队和先进的医疗设备。在哈尔滨，有几家医院在治疗病毒性角膜炎方面具有较高的声誉和专业水平。以下是一些推荐的医院：
哈尔滨医科大学附属第一医院：这是一家三级甲等综合医院，拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备。该医院的眼科是省级重点学科，擅长角膜病的诊断和治疗。
哈尔滨医科大学附属第二医院：这也是一家三级甲等综合医院，复旦版全国医院综合排名靠前。医院的眼科在病毒性角膜炎治疗方面有多位专业医生。
黑龙江省眼科医院：作为东北地区近视防控试点单位，该医院在角膜病治疗上拥有先进的医疗设备和高素质的医生团队。
黑龙江中医药大学附属第一医院：这是一家三级甲等综合医院，拥有丰富的临床经验和专业的医疗团队，适合治疗各种眼科疾病。
这些医院在治疗微小核糖核酸病毒性角膜炎方面都有较好的口碑和专业水平。建议您根据自身情况和医院的专家团队、专业程度等因素进行综合考虑，选择最适合的医院进行治疗。