全国治癫痫最好的医院有以下几家：
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北京天坛医院 ：北京天坛医院在癫痫病的治疗领域享有盛誉，拥有先进的医疗设备和专业的医疗团队，是全国治癫痫最权威医院之一。
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北京宣武医院 ：北京宣武医院也是治疗癫痫的权威医院之一，拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备，与北京天坛医院一起组建了“癫痫专家团”。
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北京协和医院 ：北京协和医院神经科在全国排名靠前，具有极高的专业水平和丰富的临床经验，是集医疗、教学、科研为一体的现代化综合三级甲等医院。
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北京万国中医院 ：该医院引入了国际先进的医疗管理模式，拥有资深的医学专家教授和博士生导师，凭借过硬的专业技术和丰富的临床经验，治疗效果显著。
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北京军海医院 ：位于北京市大兴区，是一家专业治疗癫痫的医院，接诊时间为每天08:00—17:00。
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北京京仁医院 ：也是一家治疗癫痫的医院，有患者反馈治疗效果不错。
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北京海华癫痫病医院 ：有患者反映该医院治疗癫痫效果不错。
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北大妇儿医院（第一医院）、北京市儿童医院、北京市儿研所 ：这些医院在小儿癫痫的治疗方面效果很好。
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北京华信医院、中国医科大学航空总医院、北京市三博脑科医院、北京市海淀医院、广州三九脑科医院 ：这些医院在癫痫病外科手术治疗方面效果不错，有专门的独立癫痫病病区。
综上所述，北京天坛医院、北京宣武医院、北京协和医院、北京万国中医院、北京军海医院、北京京仁医院、北京海华癫痫病医院、北大妇儿医院（第一医院）、北京市儿童医院、北京市儿研所、北京华信医院、中国医科大学航空总医院、北京市三博脑科医院、北京市海淀医院和广州三九脑科医院都是治疗癫痫的权威医院。建议患者根据自身情况选择合适的医院进行治疗。