公立三甲医院和事业单位的区别主要体现在以下几个方面：
- 性质与归属 ：
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公立三甲医院 ：属于差额拨款的事业单位，具有公益性质，同时也有一定的营利性质。它们通常由地方财政拨款供给，并受到地方政府的严格管理。
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事业单位 ：是一个更广泛的概念，包括教育、科研、文化、卫生等多个领域的非营利性组织。事业单位的经费一般由国家事业费开支，分为全额拨款、差额拨款和自收自支等类型。
- 编制与身份 ：
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公立三甲医院 ：医生和工作人员的身份分为编制内和编制外。编制内的医生享受机关事业单位养老保险，而编制外的医生则缴纳企业职工基本养老保险。此外，编制内的医生通常享有更多的福利待遇，如企业年金等。
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事业单位 ：工作人员的身份也分为编制内和编制外，待遇和福利因单位和地区而异。编制内人员通常享有稳定的工资和较好的福利待遇，而编制外人员则可能面临同工不同酬的情况。
- 管理与运营 ：
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公立三甲医院 ：虽然属于事业单位，但具有更多的自主经营权和管理灵活性。它们通常实行定额补助、定向补助和差额补助的财政管理形式，收支受到地方政府的严格管理。
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事业单位 ：管理方式因单位和性质而异，全额拨款单位如学校和图书馆等，经费由财政全额保障；差额拨款单位如医院，经费由财政部分保障；自收自支单位如企业化管理事业单位，经费由单位自行解决。
- 退休待遇 ：
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公立三甲医院 ：编制内的医生在退休时享受公务员级待遇，而编制外的医生则按照企业基本养老金的计算办法来计算基本养老金。此外，编制内的医生可能享有更多的退休福利，如企业年金等。
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事业单位 ：退休待遇因单位和身份而异，编制内人员通常享有较好的退休福利，而编制外人员的退休待遇相对较差。
综上所述，公立三甲医院和事业单位在性质、归属、编制与身份、管理与运营以及退休待遇等方面存在明显的区别。选择哪种类型的单位工作，需要根据个人的职业规划、待遇期望和工作生活平衡等因素进行综合考虑。