新农合和灵活就业险的区别主要体现在以下几个方面：
- 参保对象不同 ：
-
新农合 ：主要针对农村户籍居民及流动人口，是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。
-
灵活就业险 ：主要针对未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员，以及其他就业人员和个体工商户等。
- 缴费方式和标准不同 ：
-
新农合 ：缴费标准相对较低，一般按照收入的一定比例或固定金额缴纳，例如北京市为月收入的3%。
-
灵活就业险 ：缴费标准相对较高，通常按照收入的一定比例确定，例如北京市为月收入的1.5%。
- 保障范围不同 ：
-
新农合 ：主要提供基本医疗保险和大病保险，部分情况下可以覆盖整个家庭，包括配偶和子女。
-
灵活就业险 ：涵盖基本医疗保险、工伤保险、生育保险和失业保险等多个方面。
- 报销比例和待遇不同 ：
-
新农合 ：报销比例较低，一般在50%—70%之间，且在不同地区有所差异。
-
灵活就业险 ：报销比例较高，一般在70%—90%之间。
- 参保期限和灵活性不同 ：
-
新农合 ：参保期限较为固定，通常按年度计算。
-
灵活就业险 ：参保期限灵活，可根据需求选择不同时间段。
- 异地就医政策不同 ：
-
灵活就业险 ：可以异地就医，报销比例可能会有所不同。
-
新农合 ：异地就医的报销比例和待遇可能不如本地就医。
综上所述，新农合和灵活就业险在参保对象、缴费方式和标准、保障范围、报销比例和待遇、参保期限和灵活性以及异地就医政策等方面存在显著差异。选择哪种保险制度，应根据个人的实际情况和需求来决定。