公司交的五险（包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险）与农村的合作医疗相比， 社保（五险）更好 。以下是具体原因：
- 缴费金额和比例 ：
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社保的医疗保险个人缴费一般在200元左右，其中18岁以下在50元左右；而新农合的个人缴费在10-20元之间。
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社保的医疗保险缴费由用人单位和职工共同缴纳，企业分摊大部分保费，个人缴费较少；而新农合则需要个人全额缴费。
- 保障范围和报销比例 ：
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社保的医疗保险报销比例较高，通常在50%-70%，且报销范围包括国家医保药品目录，有2000多种药。
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新农合的报销比例较低，一般在40%左右，且报销范围较窄，主要集中在乡镇卫生院和县级医院。
- 应用场景和保障内容 ：
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社保不仅包括医疗保险，还包括养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险，覆盖范围更广，应用场景更多。
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新农合只是一个医疗保险，主要用于就诊，纳入新农合的一些病种和药物可以报销。
- 长期保障 ：
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社保医疗保险一般需要累计缴满20-30年才能享受终身医疗待遇。
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新农合是一年一次的缴费，交一年保一年，断缴那一年就不能报销了。
- 其他福利 ：
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社保还提供其他福利，如退休金、失业金、生育津贴等。
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新农合没有这些福利，且生孩子报销部分费用，没有工资补助。
综上所述，从保障范围、报销比例、长期保障和其他福利等方面来看，公司交的五险（社保）明显优于农村的合作医疗。因此，建议在经济条件允许的情况下，尽量选择缴纳社保。