覆盖范围、报销标准和适用对象
五险一金和农村合作医疗（简称新农合）在多个方面存在显著差异：
- 覆盖范围 ：
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五险一金 ：主要针对城镇职工，包括企、事业单位职工，以及灵活就业者等。
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新农合 ：主要针对拥有农村户口的城乡居民，现已并入城乡居民医保体系。
- 缴费标准 ：
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五险一金 ：缴费标准较高，通常按照本市上年度在岗职工平均工资的一定比例和基数进行缴费。
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新农合 ：个人缴费标准较低，每年100元至1000元不等，政府给予一定补贴。
- 筹资结构 ：
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五险一金 ：由用人单位和参保人共同缴纳，用人单位缴的是主要部分。
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新农合 ：主要由政府补贴，个人缴费，同时集体也会给予一定支持。
- 待遇标准 ：
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五险一金 ：待遇不仅包括医疗保险，还包括养老保险、生育保险、失业保险、工伤保险和住房公积金，待遇标准相对较高。
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新农合 ：待遇水平较低，主要提供基础养老金和医疗保险，且报销比例有限。
- 保障期限 ：
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五险一金 ：医疗保险需连续缴费满至少15年方可享受终身医保待遇。
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新农合 ：保障期限通常为一年，需每年进行投保。
- 个人医保账户 ：
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五险一金 ：医疗保险设有个人医保账户，方便投保人存储多余资金，便于日后医保需求时调拨。
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新农合 ：一般没有个人医保账户，报销比例较低。
- 法律依据 ：
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五险一金 ：根据《中华人民共和国社会保险法》规定，五险是法定的，一金（住房公积金）不是法定的。
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新农合 ：根据《关于加快推进新型农村合作医疗试点工作的通知》等政策文件，新农合是由政府组织、引导、支持的农民医疗互助共济制度。
综上所述，五险一金和新农合在覆盖范围、缴费标准、筹资结构、待遇标准、保障期限、个人医保账户以及法律依据等方面均存在明显差异。个人可以根据自己的实际情况和需求选择参加其中一个或两个保障体系。