城镇居民医保和新农合医保的主要区别包括：
- 参保对象 ：
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新农合 ：主要参保对象为农村居民。
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城镇居民医保 ：主要参保对象为没有参加城镇职工医疗保险的城镇居民。
- 报销比例 ：
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新农合 ：在三甲医院的报销比例较低，通常为30%，但在乡镇医院的报销比例较高。
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城镇居民医保 ：在三甲医院的报销比例较高，通常可以达到50%左右，通过逐级转院的报销比例甚至可达70%。
- 政府补助资金 ：
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新农合 ：政府补助普遍高于城镇居民医保，每人每年补助资金平均在400到500元左右。
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城镇居民医保 ：政府补助相对较少。
- 参保方式 ：
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新农合 ：在农村实行按户缴纳的方式。
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城镇居民医保 ：实行按人来缴纳。
- 管理体制 ：
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新农合 ：多数地方由卫生部门管理。
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城镇居民医保 ：主要由人社部门管理。
- 保障待遇 ：
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新农合 ：主要保障农村居民的基本医疗需求，尤其是大病医疗。
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城镇居民医保 ：保障内容包括住院、门诊大病和普通门诊，待遇水平相对较高。
- 医药目录 ：
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新农合 ：可报销的医药目录相对较少，尤其在城镇医院看病时报销数额较低。
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城镇居民医保 ：可报销的医药目录较齐全，报销范围较广。
- 起付线和封顶线 ：
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新农合 ：在乡镇医院的起付线较低，但在市级医院的报销比例和封顶线相对较低。
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城镇居民医保 ：起付线较高，但在大医院的报销比例和封顶线相对较高。
综上所述，城镇居民医保和新农合医保在参保对象、报销比例、政府补助、参保方式、管理体制、保障待遇、医药目录以及起付线和封顶线等方面存在明显差异。随着政策的推进，许多地区已经实现了两者的合并，统称为“城乡居民基本医疗保险”，以实现更公平的医疗保障。