新生儿农合和医保的区别主要体现在以下几个方面：
- 投保对象不同 ：
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新生儿医保 ：主要针对城镇户籍的居民，并且只能在户籍当地参保，由人社部门管理。
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农村合作医疗（新农合） ：主要针对农村户籍居民，由卫生部门管理。
- 管理部门不同 ：
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新生儿医保 ：由人社部门管理。
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新农合 ：由卫生部门管理。
- 报销范围和比例不同 ：
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新生儿医保 ：报销范围比新农合广，报销比例也较高。
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新农合 ：覆盖面广，适用于农村户籍居民，报销比例相对较低。
- 性质和目标取向不同 ：
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新农合 ：属于政府行为，由国家规定实施，具有非盈利性质，体现国家的社会政策。
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新生儿医保 ：是一种商业行为，被保险人跟保险人之间是一种平等自愿的契约关系，保险公司的目标是实现利益的最大化。
- 资金来源不同 ：
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新农合 ：由国家及地方财政、个人来分担。
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新生儿医保 ：完全由投保人负担。
- 补偿水平和保障方式不同 ：
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新农合 ：更具人性化，补偿水平根据各地物价指数不同，且对特困户和五保户有优惠政策。
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新生儿医保 ：给付水平的确定只考虑投保人缴费额的多少，主要体现货币支付的关系。
- 可承担风险的范围不同 ：
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新农合 ：覆盖面广，对成年人也有适用，且特困户和五保户无需缴纳费用即可参加。
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新生儿医保 ：主要针对新生儿，且购买条件相对宽松，没有年龄限制。
建议
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新生儿医保 ：建议家长在宝宝出生后尽快办理，以确保新生儿能够享受到全面的医疗保障。
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新农合 ：对于农村户籍的家庭，新农合是一个重要的医疗保障选择，尤其是对于经济条件一般的家庭。
通过以上分析，可以看出新生儿农合和医保在投保对象、管理部门、报销范围、性质、资金来源、补偿水平和可承担风险等方面存在明显差异。家长可以根据自身情况选择合适的保险制度，以确保新生儿能够获得必要的医疗保障。