公司交的医保（职工医疗保险）和农村的医保（新型农村合作医疗，现称城乡居民医疗保险）之间存在以下主要区别：
- 覆盖对象 ：
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职工医疗保险 ：针对的是城镇所有用人单位的在职职工。
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新型农村合作医疗 ：主要针对农村户口的居民，且必须以家庭为单位整户参加。
- 缴费主体 ：
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职工医疗保险 ：由用人单位和社会成员个人共同缴纳。
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新型农村合作医疗 ：由农民自愿参加，政府组织、农民、集体和政府共同出资。
- 缴费方式 ：
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职工医疗保险 ：具有强制性，单位和个人每月都需要缴纳，且需达到一定的缴费年限。
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新型农村合作医疗 ：农民自愿参加，每年集中缴费一次。
- 报销比例 ：
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职工医疗保险 ：在定点医院就医的报销比例较高，通常在70%以上，且住院费用的报销比例也较高。
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新型农村合作医疗 ：报销比例相对较低，尤其在市级以上医院的报销比例较低，但在农村乡镇卫生院的报销比例较高。
- 保障待遇 ：
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职工医疗保险 ：参保人员完成缴费年限后可以终身享受医疗保险待遇，且包含门诊报销、住院补偿以及大病保险等多方面保障。
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新型农村合作医疗 ：保障期限为一年，交一年保一年，主要报销农村居民看病就医产生的费用，保障力度相对较低。
- 管理方式 ：
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职工医疗保险 ：由医疗保障局负责管理，单位和个人共同缴纳费用。
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新型农村合作医疗 ：也归医疗保障局管理，但缴费和报销由农民自愿选择并办理。
综上所述，公司交的医保和农村的医保在覆盖对象、缴费主体、缴费方式、报销比例、保障待遇和管理方式等方面都有明显的区别。建议根据自身情况选择适合的医保类型，以确保获得充分的医疗保障。