公司交了五险一金后，不需要再单独交农村合作医疗 。以下是相关理由：
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五险一金的覆盖范围 ：五险一金包括养老保险、医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险，而农村合作医疗（新农合）主要覆盖门诊医疗费用、住院医疗费用和大病医疗费用等。五险中的医疗保险部分已经包含了新农合所覆盖的范围，因此两者在医疗保险方面存在重叠。
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法律规定 ：根据《中华人民共和国社会保险法》第五十八条，用人单位应当为其职工申请办理社会保险登记，包括医疗保险。这意味着，一旦职工在公司参加了五险一金，其医疗保险部分就已经得到了保障，无需再通过新农合进行重复保障。
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重复报销问题 ：医疗保险不能重复报销。如果一个人同时参加了五险一金和新农合，在生病报销时，只能选择其中一种医疗保险进行报销，不能同时享受两种待遇。
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经济考虑 ：五险中的医疗保险通常具有较高的保障水平，报销比例也较新农合更高。因此，从经济角度考虑，交五险一金后，再交新农合可能并不划算。
综上所述，公司交了五险一金后，不需要再单独交农村合作医疗。职工可以通过五险一金获得全面的医疗保障，而新农合则可以作为补充，但在实际操作中，许多人选择不再交新农合，以避免重复报销和增加经济负担。