交五险需要停农村医保的主要原因在于 五险中的医疗保险与农村医保存在冲突，不能同时享受这两项待遇 。具体原因如下：

1. 法律角度 ：五险中的基本医疗保险与农村医保并不冲突，但劳动者只能享受其中一种医疗保险的待遇。通常情况下，五险中的医疗保险报销额度更高，因此，即使同时参保，也只能选择其中一种进行医疗费用报销。

2. 保障范围 ：五险，即基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险，是单位为员工缴纳的法定社会保险，其中基本医疗保险已经涵盖了员工在城镇的医疗需求。而农村合作医疗，主要是针对农村居民设立的一种医疗保险制度，用于保障农村居民在医疗方面的基本需求。

3. 重复缴费 ：如果个人在当地上班，且单位已经为其缴纳了五险，那么可以考虑停掉农村医保，因为五险中的医疗保险已经能够提供足够的保障。停掉农村医保后，可以避免不必要的重复缴费。

4. 实际操作 ：对于原本是农村居民的员工，如果他们已经参加了农村合作医疗，并且在单位又办理了五险，那么在医疗报销方面，两者并不能同时报销。因此，这部分员工在实际操作中可能会选择停止缴纳农村合作医疗的费用，以避免重复缴费。

综上所述，交五险需要停农村医保主要是为了避免重复缴费和确保能够享受更高额度的医疗保险待遇。建议根据个人实际情况和需求，选择参加五险中的医疗保险或继续缴纳农村医保。