农村合作医疗与社保之间的冲突主要体现在医疗保险部分，具体表现为 一个人不能同时享受两项待遇 。当个人同时参保这两项保险时，在出险后只能选择其中一项进行报销。
为了解决这一冲突，有以下几种建议：
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优先考虑社保 ：鉴于社保的报销范围通常更为广泛，且能享受的待遇相对更优，建议优先选择参加社保，特别是对于已经购买了农村合作医疗的农民朋友，如果条件允许，可以考虑转为社保，以享受更为全面和优质的保障服务。
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注销农村合作医疗 ：如果选择参加社保，需要注销农村合作医疗。农村合作医疗每年交费一次，不产生个人账户余额，因此不存在转移费用的问题。
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商业医疗保险作为补充 ：如果希望获得更为全面的医疗保障，可以选择购买商业医疗保险作为社保的补充。商业医疗保险与农村合作医疗没有冲突，虽然都提供医疗保障，但一个是商业保险，一个属于社保范畴。
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了解政策 ：在参保前，了解清楚社保和新农合的不同规定和报销流程，避免发生混淆和冲突。一些地方已经开始探索医保信息互认制度和数据互通，提高参保人的便利程度。
综上所述，解决农村合作医疗与社保冲突的关键在于选择合适的保险计划，并根据个人实际情况进行合理配置。优先选择社保并注销农村合作医疗，同时可以考虑购买商业医疗保险作为补充，以确保获得全面的医疗保障。