有冲突
农村合作医疗和医疗保险 存在冲突 ，具体表现如下：
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不能同时享受两种待遇 ：根据多篇文献，参加农村合作医疗（新农合）后，如果再参加公司上的社会保险（如城镇职工基本医疗保险），则不能同时享受两种待遇。需要注销农村合作医疗，否则将违反国家规定。
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缴费方式不同 ：新农合每年缴费一次，不产生个人账户余额，因此不存在转移费用的问题。而城镇职工基本医疗保险由用人单位和个人共同缴纳，存在个人账户余额。
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覆盖对象不同 ：新农合主要面向农村居民，且必须以家庭为单位整户参加。而城镇职工基本医疗保险则涵盖了更广泛的城镇居民和职工。
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政策互斥 ：国家政策规定，个人不得重复参加两种或多种具有相同或类似功能的医疗保险，因此新农合和社保医保在参加资格上是互斥的，即不能同时并存。
农村合作医疗和医疗保险存在明显的冲突，个人在选择参保时应权衡利弊，避免重复参保带来的不必要的经济负担。建议选择参加职工医疗保险，并注销农村合作医疗。