城市农村合作医疗的报销比例根据就诊机构的不同而有所差异，具体如下：
- 门诊补偿 ：
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在村卫生室及村中心卫生室就诊，医疗费用可报销60%。
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在乡卫生院就诊，医疗费用可报销40%。
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在二级医院就诊，医疗费用可报销30%。
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在三级医院就诊，医疗费用可报销20%。
- 住院报销比例 ：
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在乡卫生院住院，医疗费用可报销60%。
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在二级医院住院，医疗费用可报销40%。
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在三级医院住院，医疗费用可报销30%。
- 大病补偿 ：
- 对于参加新农合的住院病人，若一次性或全年累计的医疗费用超过5000元，将分段进行赔偿。具体而言，5001元至1万元的部分可补偿65%，10001元至1.8万元的部分可补偿70%。
- 起付线 ：
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市外医院起付线为1000元，补偿比例为55%。
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二级医院起付线为200元，补偿比例为70%。
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三级医院起付线为800元，补偿比例为60%。
- 其他特殊规定 ：
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60周岁以上老人在指定卫生院住院，治疗费和护理费每天可补偿10元，限额200元。
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新型农村合作医疗基金还报销支付特殊病种，如恶性肿瘤化疗、放疗，重症尿毒症的血透和腹透等，具体以当地政策为准。
建议：
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选择合适的医疗机构 ：根据就诊机构的级别选择合适的医疗机构，以最大化报销比例。
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注意起付线 ：了解不同医疗机构的起付线，确保医疗费用在起付线以上，才能享受报销。
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关注大病补偿 ：对于大额医疗费用，了解大病补偿政策，确保能够获得足够的补偿。