云南昆明治疗结核性巩膜炎较好的医院包括昆明市第三人民医院、昆明医科大学第一附属医院等公立三甲医院，其中昆明市第三人民医院作为结核病定点医院，在专科诊疗和综合实力上更具优势。
- 专科医院推荐：昆明市第三人民医院是昆明市结核病定点救治医院之一，拥有丰富的结核病诊疗经验，对结核性巩膜炎等并发症的诊治具备专业团队和技术支持。
- 综合医院选择：昆明医科大学第一附属医院、云南省第一人民医院等三甲医院眼科实力较强，可结合结核病治疗与眼部专科干预，提供多学科协作诊疗。
- 治疗注意事项：结核性巩膜炎需同时进行抗结核治疗和眼部对症处理，患者应严格遵循医嘱用药，定期复查，避免擅自停药导致病情反复。
建议根据病情严重程度优先选择专科医院，或通过转诊机制结合综合医院资源，确保治疗的系统性和规范性。