在海南保亭，治疗细菌性角膜溃疡的医院选择可以参考以下信息：
保亭黎族苗族自治县人民医院
- 综合实力：综合性医院，设有五官科，能够处理多种眼科疾病。
- 科室设置：配备先进的医疗设备，如彩超室、经颅多普勒室等，提供全面的检查和诊断。
- 交通便利：位于保亭县保城宝亭大道北侧，交通便捷。
海南爱尔新希望眼科医院
- 专业眼科医院：爱尔眼科集团旗下医院，专注于眼科疾病的诊治。
- 重点科室：设有“屈光性白内障手术示范中心”，专注于白内障、视物重影等眼科问题的治疗。
- 专家团队：拥有经验丰富的眼科专家团队，提供个性化诊疗方案。
以上医院在眼科疾病诊疗方面具有专业优势，能够提供高质量的医疗服务。建议根据自身症状和需求，提前预约挂号，以便更快获得诊治。