根据权威信息源，新疆吐鲁番地区治疗炎症性肠道疾病及其伴发葡萄膜炎的医院推荐如下：
吐鲁番市人民医院
内科医疗设施齐全，可综合治疗炎症性肠道疾病及伴发葡萄膜炎。
新医大一附院
新疆医科大学第一附属医院，综合实力强，诊疗经验丰富，适合复杂病例。
新疆自治区人民医院
三级甲等综合医院，医疗资源丰富，口碑良好。
其他建议 ：
若需中医治疗，可考虑吐鲁番市人民医院中医科。
鄯善县人民医院内科虽为公立医保单位，但信息权威性较低，建议优先选择市一级医院。
建议根据病情严重程度及医院专科特色进一步咨询医院分诊部门。