北京大学第三医院（简称“北医三院”）和其北方院区是同一所医院的不同组成部分，但它们在地理位置、科室设置和功能定位上存在一定差异。以下是它们的详细对比：

1. 地理位置与交通

• 北医三院（院本部）
  地址：北京市海淀区花园北路49号
  交通：地铁10号线西土城站或牡丹园站下车，步行即可到达。

• 北方院区
  地址：北京市海淀区蓝靛厂南路车道沟10号
  交通：地铁10号线车道沟站B口出，步行约700米即可到达，周边公交站点较多，交通便利。

2. 科室设置与医疗特色

• 北医三院（院本部）
  是一所综合性三甲医院，科室齐全，涵盖56个科室，包括生殖医学中心、骨科、运动医学科、妇科、疼痛科、整形外科、病理科等，具有多个国家级重点学科。

• 北方院区
  作为北医三院的直属院区，主要科室包括心血管内科、呼吸与危重症医学科、内分泌科、肾内科、消化科、神经内科、骨科、泌尿外科、妇科、眼科、疼痛科等，科室设置相对集中，更适合处理专科疾病。

3. 功能定位与患者群体

• 北医三院（院本部）
  作为总院，承担全面的医疗、教学、科研任务，是综合性医疗服务和疑难重症诊治的中心。

• 北方院区
  主要服务于周边社区居民及专科患者，功能更倾向于提供常见病、多发病的诊疗服务，同时承担部分教学和科研任务。

总结

北医三院和北方院区在地理位置、科室设置和功能定位上有所不同。院本部以综合性医疗服务为主，科室齐全，适合处理疑难重症；而北方院区则更专注于常见病和专科疾病的诊疗，同时为周边居民提供便利的医疗服务。如果您需要专科诊疗或综合性医疗服务，可以根据具体需求选择合适的院区就诊。