北京大学自1898年创办以来，至今已有29任校长。以下是部分历任校长的名单：
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孙家鼐（1898年7月—1900年春）
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许景澄（1899年7月—1900年7月）
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张百熙（1902年1月—1904年2月）
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张亨嘉（1904年2月—1906年2月）
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李家驹（1906年2月—1907年7月）
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朱益藩（1907年7月—1907年12月）
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刘廷琛（1907年12月—1910年9月）
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劳乃宣（1911年11月—1912年2月）
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严复（1912年2月—1912年10月）
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章士钊（1912年10月—1912年12月）
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何燏时（1912年12月—1913年11月）
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蔡元培（1916年12月—1927年8月）
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蒋梦麟（1930年12月—1945年9月）
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胡适（1946年9月—1948年12月）
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马寅初（1951年6月—1960年3月）
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陆平（1960年3月—1966年6月）
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周培源（1978年7月—1981年3月）
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丁石孙（1984年3月—1989年8月）
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吴树青（1989年8月—1996年8月）
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许智宏（1999年11月—2008年11月）
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周其凤（2008年11月—2013年3月）
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王恩哥（2013年3月—2015年3月）
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林建华（2