灵活就业不能交医保的原因主要有以下几点：

1. 系统故障或升级 ：医保系统可能因暂时性故障或升级而无法使用，导致灵活就业人员无法正常缴费。

2. 银行账户问题 ：用于个人缴费的银行账户如果存在冻结、挂失、销户等异常情况，将无法正常扣款。

3. 扣款协议失效 ：如果扣款协议失效，也会导致灵活就业人员无法按时缴费。

4. 缴费比例高 ：灵活就业医保的缴费比例通常较高，相比于在职职工和用人单位一起缴纳的职工医保，或者是个人以城乡居民的身份进行的城乡居民医保，灵活就业医保的缴费压力更大。

5. 资金压力 ：灵活就业人员大多没有固定工作，需要自己承担全部社保费用，资金压力较大，难以承受较高的医疗保险费用。

6. 断缴风险 ：灵活就业医保一旦断缴，次月将无法享受医保报销待遇，且断交超过三个月会导致原先的缴纳年限被清零。

7. 报销比例低 ：灵活就业人员参加的职工医保报销比例相对较低，可能无法满足他们的医疗保障需求。

8. 无个人账户 ：部分地区的灵活就业人员如果选择按照最低缴费档次缴费，可能无法建立个人医保账户。

9. 退休返钱少 ：部分地区灵活就业医保参保人退休后的医保返钱标准比退休职工低。

综上所述，灵活就业人员面临多方面的压力和风险，导致他们难以承担医保费用。建议政府和社会各界加强对灵活就业人员的医疗保险支持和扶持力度，扩大医疗保险报销范围，降低医疗保险费率，以保障他们的基本医疗保障需求。