合作医疗的门诊检查费是可以报销的，但具体的报销比例和限额因地区和医疗机构级别而异。以下是2025年的一些报销标准：
门诊报销标准
村卫生室及村中心卫生室就诊：报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
镇卫生院就诊：报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
二级医院就诊：报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
三级医院就诊：报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
中药发票附上处方每贴限额1元。
镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。
门诊慢性特殊病种报销范围
门诊慢特病报销范围包括高血压、糖尿病、慢性肾功能衰竭等慢性疾病。在相应病种年度报销限额内，按新规范围内费用的70%（乙类项目先由个人自付10%后计算）进行报销。
报销条件
参保条件：新农合主要面向农村居民，参保人员需具有农村户籍，并按时缴纳新农合费用。
报销条件：在定点医疗机构就诊，使用符合基本医疗保险目录内的检查项目。
建议您在就诊前咨询当地的医保部门或定点医疗机构，了解具体的报销政策和流程。